Koc Sistem’de sistem analisti ve yazilim muhendisi olarak calisirken, cevremdeki arkadaslarimla beyin, algi ve ogrenme ile ilgili yaptigimiz konusmalar beni her gecen gun doga ve biyoloji bilimlerine daha da yaklastiriyordu. Insan kaynaklari mudurumuze, biyoloji bilimleri ile ilgili doktora yapmak istiyorum dedigimde, inan ben de boyle bir karari kendim icin almak cok isterdim ama cok zor, yolun acik olsun, her zaman seninle olacagiz demisti. Ben de biyoloji bilimleri ve biyomuhendislik programinda, matematik ve bilgisayar bilimleri ile biyoloji bilimlerini bir potada eritebilecegim, biyoinformatik alaninda calismalarima basladim. Sabanci universitesindeyken yaptigimiz calismalar aralarinda, Ingiltere, Japonya, Amerika ve Avusturalya’nin da oldugu bir cok ulkede gerceklestirilen konferanslarda ilgiyle karsilandi. Boylece, Turkiye’de ve Ingiltere’de sistem biyoloji, biyosentetik ve biyoinformatik alaninda dort sene boyunca konferans organizasyonlarinda gorev aldim. Daha sonra, Amerika’da Kansas Universitesinde bulunan ve tezimin konusu olan, protein katlanma problemi ile ilgili, CASP yarsimasinda son uc donemdir en iyi performansi gosteren bir profesorun yaninda calismalarima devam ettim. Konuyla ilgili Nature Protocols’te yayinlanan makalemiz diger bilim insanlari tarafindan 250’nin uzerinde refere edildi.
Daha sonra University of Massachusetts Medical School’da benim icin tamamen yeni bir alan olan RNA’ler uzerine calismaya basladim. Alzheimer ve ALS gibi hastaliklarda rolu olan TDP43 proteinin RNA hedeflerini bulmak uzere Harvard Universitesi ve Texas Southwestern Medical Center ile yurttugumuz calisma basari ile sonuclandi ve bu konuda calisan diger gruplardan cok daha once makalemizi yayinlayabildik. JBC, calismamizi haftanin makalesi olarak secti, kapagina tasidi ve dergide ilk yazarlarin biyografilerini yayinladi. TDP43 ile ilgili calismalarima, Mayo Clinic ile birlite, arsenik stresi uygulanmis hucrelerdeki regulasyon farkliliklari basligi altinda yurutmeye devam ediyorum. Diger taraftan, ileri RNA sekanslama yontemleri kullanarak exon baglanti kompleksinin(EJC) tum insan genomundaki gorevlerini, yine sekanslama yontemileriyle tekli ve coklu ribozom profillerindeki farkliliklar ve staufen proteinin RNA hedeflerinin tum insan genomunda belirlenmesi, calisma prensiplerinin anlasilmasi diger arastirma konularim.
Sabanci Universitesi, bunyesinde bulunan degerli bilim insanlari ile dunya olceginde basarili bireyler yetistiriyor, onlara vizyon asiliyor ve bir sonraki adimlarina en iyi sekilde hazirliyor. Bununla birlikte ogrencilerine sunmus oldugu her yonuyle zengin egitim olanaklari ile yeni fikirlerin yesermesine ve evrilmesine yol aciyor. En onemlisi mezun olsaniz da, uzakta olsaniz da her zaman destegini hissettiriyor.
